Hakone terkenal dengan onsen (air panas semulajadi) yang mengalir terus dari sumber. Hotel di sini menawarkan pengalaman ryokan tradisional hingga hotel moden dengan kolam air panas dalaman dan luaran. Contohnya, Gora Kadan (mewah, kolam renang dalaman) dan Yoshiike Ryokan (taman Jepun, onsen air terus dari sumber) terletak berhampiran stesen. Kawasan popular termasuk Gora, Hakone Yumoto, dan Ashinoko. Bajet bermula sekitar RM300 untuk penginapan bajet seperti Mount View Hakone, manakala ryokan mewah seperti Gora Kadan boleh mencecah RM1,500 semalam.
Selain onsen, hotel seperti Hotel Green Plaza Hakone menawarkan pemandangan Gunung Fuji dari kolam air panas terbuka, manakala Mount View Hakone menyediakan air onsen keruh (nigori-yu) yang jarang ditemui. Kemudahan lain termasuk tempat letak kereta percuma, WiFi percuma, dan sarapan. Bagi yang mencari kemudahan, Yumoto Fujiya Hotel terletak 3 minit berjalan kaki dari Stesen Hakone Yumoto. Tempah awal untuk promosi istimewa.