Pulau Perhentian Besar menawarkan pelbagai pilihan penginapan bajet yang sesuai untuk pelancong dengan bajet terhad. Hotel-hotel seperti chalet dan resort kecil bertaburan di sepanjang pantai Teluk Dalam dan PIR Beach, menyediakan bilik berhawa dingin dengan balkoni peribadi, restoran yang menyajikan masakan tempatan dan barat, serta akses mudah ke aktiviti snorkeling dan menyelam. Kos penginapan biasanya bermula dari RM100 hingga RM200 semalam, bergantung pada kemudahan dan musim. Kebanyakan hotel tidak termasuk sarapan, tetapi restoran di dalamnya menawarkan pilihan makanan halal. Pelawat perlu menaiki bot 30 minit dari Jeti Kuala Besut untuk sampai ke pulau.
Antara hotel bajet yang popular termasuk Flora Bay 2 yang menawarkan balkoni peribadi dan pusat menyelam dalaman, serta Flora Bay 1 yang mempunyai pantai peribadi dan aktiviti kanu. Samudra Beach Chalet menawarkan pantai peribadi dan pemandangan laut, sementara Mama's Chalet Pulau Perhentian Besar terletak hanya 4 minit berjalan kaki ke PIR Beach, sesuai untuk keluarga dengan bilik keluarga dan restoran halal. Fauna Beach Chalet pula menawarkan pantai peribadi serta masakan Thai dan Asia. Kesemua hotel ini sesuai untuk pelancong individu, pasangan, dan keluarga yang mencari percutian pantai mampu milik dengan kemudahan asas yang memuaskan.